思い出したので、一応メモ。
$soap_result = $soapclient->call('method_name', $parameters);
$soapclient->debug_str = ''; // デバッグ文字列のクリア
nusoapで何かやったら、debug_str をクリアしておいたほうが良い。デバッグモードでなくてもdebug_strには文字列がどんどん追加されていく。節約志向で$soap_clientを一回だけnewして使いまわしていたら、逆にどんどんメモリ使用量が増えていく結果になってしまっていた。